首先，您得先了解，這完全是兩件不同的事。原理上都是在利用氫分子保健身體，但是作用的路徑卻完全不一樣。

氫分子被人體使用的方法，包含呼吸氫氣、飲用氫水和注射氫氣鹽水溶液，也都有相關的研究證據支持，對多種疾病具有潛在的治療價值。其中喝氫水與注射氫水都是通過水作為載體吸收，氫分子透過消化道的路徑為人體所用。中國的康志敏教授提到，吸氫氣的時候，氫氣會在肺部做氣血交換，30分鐘就會到達腦部，60分鐘氫分子就會到全身的肌肉與血管與神經，不過要進入到關節之中，則需要四個小時。

國際知名的自由基研究學者，更是美國自由基生物醫學學會(F-SfRBM)唯一亞洲籍院士，劉燦榮教授則提到，吸氫氣還有一個會作用的器官，是肝臟。不同個體和不同疾病之間，需要攝取氫分子的方式也不同。從初步使用經驗上看，透過喝氫水，攝入氫分子，對消化道疾病的效果比較理想，呼吸氫氣則是對呼吸系統的疾病與腦部的疾病，是更理想的氫分子給予方式。

例如飲用氫水對許多便秘患者效果非常好，但呼吸則氫氣沒有這樣的效果。不過考量到便秘的症狀本身就對於水的攝入有關，因此其中的機轉還需要更細部的研究。而對睡眠改善方面，呼吸氫氣的效果則比氫水更明顯。

人一天的建議飲水量位於 1800 - 2500 CC，但呼吸氫氣則沒有此限。因此透過呼吸的方式不僅可以更多吸收氫氣，以治療疾病為目的可以呼吸氫氣，以促進健康。氫氣作為一種非常安全的抗氧化劑，只要有效果就非常值得使用，呼吸飲用等多種方法聯合使用也應該嘗試。

自由基是百病之源與老化之源，而且時時刻刻在我們體內生成，可以說是人類健康的大敵。自由基是人體代謝產生的產物，也可能來自環境，其活性極強，容易攻擊其他物質，並形成連鎖反應造成大破壞，若累積過量自由基，與老化和癌症等疾病息息相關。近來，根據日本的氫氣抗自由基的研究，發現氫氣有助於細胞和實驗動物緩解自由基毒性。而21世紀的科學研究證實：氫分子能與自由基結合成水，排出體外。所以氫呼吸是一種正本清源、簡單有效的保健養生方法。